Samara Portal Technology, Computers

Самарский портал "Технологии, компьютеры"

Компания ASUS совместно со специалистами Центра Биогеронтологии и Регенеративной Медицины, а также лабораториями Федерального научно-клинического центра детской гематологии, онкологии и иммунологии имени Дмитрия Рогачёва (ФНКЦ ДГОИ, www.fnkc.ru) продолжает принимать активное участие в поиске новых методов и способов в борьбе против рака и старения. Сегодня российским ученым в программе ASUS Fellows удалось разработать уникальный биоинформатический алгоритм для математического анализа внутриклеточных сигнальных путей OncoFinder, который поможет провести количественный анализ функциональных изменений внутри клетки и свести к минимуму ошибки экспериментальных приборов.

В настоящее время все больше усилий в области современной молекулярной биологии направлены на анализ экспрессии определенного набора генов, который позволит разработать таргетную терапию лечения ряда наследственных и возраст-зависимых заболеваний, обнаруженных у человека. С каждым годом данные, полученные методами полногеномного секвенирования и микрочипирования, увеличиваются с небывалой быстротой, но необходимых инструментов для их анализа практически не существуют. Тем более, используя эти данные, с большой вероятностью можно получить ошибочные результаты на разных стадиях приготовления образцов, анализа и обработки полученных данных.

«Два года назад мы начали сотрудничать с лабораториями Александра Жаворонкова и Антона Буздина в ФНКЦ Детской Гематологии, Онкологии и Иммунологии им. Д. Рогачева и оснастили их высокопроизводительным оборудованием нашей компании (ноутбуками ASUS G750JX, планшетными компьютерами ASUS Memo Pad FHD 10 FHD (ME302KL), ASUS Transformer Pad TF701T, панорамными мониторами ASUS  PB298Q и сетевым оборудованием), а также поддержали программу ASUS Fellows для молодых ученых, – говорит Алекс Ким (Alex Kim), глава российского представительства ASUS. –  Мы очень рады, что мощностей нашей продукции хватает для проведения сложных высокопараллельных вычислений для обработки гигантских массивов биомедицинских данных, а размеры и разрешения наших мониторов позволяют визуализировать внутриклеточные сигнальные пути с тысячами элементов. Разработанная сегодня система  OncoFinder – это по-настоящему прорывная технология, которая открывает  новые возможности в борьбе против рака и старения. Она пользуются большим спросом за рубежом, и, надеюсь, в скором времени приобретет популярность в России».

Технология OncoFinder на основе транскриптомных данных дает количественную и качественную характеристику активации сигнальных путей и сравнивает эти показатели с нормой. Этот биоинформатический инструмент позволяет с большой точностью отслеживать любые функциональные изменения внутри клетки.

В разработке алгоритма OncoFinder приняли участие более пятидесяти передовых ученых из различных организаций. По словам специалистов, технология OncoFinder может применяться не только для сравнения транскриптомных данных, полученных с помощью разных платформ и подбора таргетных препаратов в персонализированной медицине рака, но и для предсказания эффективности различных препаратов и их комбинаций для лечения возраст-зависимых заболеваний.

«По большинству параметров наш центр является крупнейшим детским онкогематологическим центром в мире, и в наши задачи входят не только высококвалифицированная медицинская помощь, но и научные исследования, которые в перспективе могут спасти миллионы жизней, –  рассказывает профессор С. А. Румянцев, заместитель директора по науке, ФНКЦ Детской Гематологии, Онкологии и Иммунологии им. Д. Рогачева, заведующий кафедрой трансляционной и регенеративной медицины МФТИ, заведующий кафедрой онкологии, гематологии и лучевой терапии, РНИМУ им Н.И. Пирогова. – Финансирование передовых научных исследований сегодня зависит не только от государства, но и от самих ученых и качества их работы. Мы выражаем искреннюю благодарность компании ASUS в лице Алекса Кима и Анжелы Сю за поддержку молодых ученых из различных ВУЗов, которые теперь имеют возможность работать в нашем центре на мощном оборудовании ведущего мирового производителя компьютерной техники, а также публиковать свои научные труды в специализированных международных изданиях. Помимо этой и многих других публикаций в журналах Frontiers, работы с участием ASUS Fellows были опубликованы в таких ведущих изданиях, как PNAS, Nature Leukemia, Oncotarget, Cell Cycle и многих других, а разработанные российскими учеными технологии начинают постепенно внедряются в практику в России и за рубежом».

Данные об этом исследовании опубликованы в журнале Frontiers in Molecular Biosciences (http://journal.frontiersin.org/Journal/10.3389/fmolb.2014.00008/full).

13-й Фестиваль интеллектуальных игр в Самаре: вчера, сегодня, завтра

HP LaserJet Ultra – очередная революция в печати